به منظور انجام یک شبیه سازی دقیق و علمی نیاز است که از تکنیک هایی برای این منظور استفاده شود. بنابراین در این فیلم آموزشی تکنیک ها و مفاهیم بصورت ساده طبق سر فصل زیر ارائه می شود.

• سرعت اولیه
• تعادل و نمونه گیری
• شرایط مرزی متناوب
• کمینه سازی انرژی
• شعاع قطع
• ترموستات
• باروستات
• تابع توزیع شعاعی (RDF)
• متوسط مجذور جابجایی (MSD)

لازم به ذکر است که تک تک این تکنیک ها و مفاهیم الگوریتم های بسیار پیچیده دارند که اطلاع دقیق از آنها در روند شبیه سازی اثر چندانی ندارد، بنابراین فقط به روابط ساده، مفاهیم و کاربردهای آنها اشاره می شود.

اولین مرجع تخصصی و جامع شبیه سازی مولکولی (نانوفناوری محاسباتی) در ایران