بخش هوایی گیاه که از خاک خارج می شود، ساقه نامیده می شود. ساقه هوایی گیاه حامل محور اصلی جوانه انتهایی ، جوانه های کناری، برگ ها و شاخه های فرعی، گل ها و میوه هاست. ساقه بر خلاف ریشه ژئوتروپیسم منفی دارد و در نتیجه در جهت عکس ریشه رشد می کند.

 وظائف ساقه به شرح زیر است:

 
1- هدایت آب و مواد غذایی جذب شده توسط ریشه، برگ ها و انتقال و توزیع مواد غذایی ساخته شده در برگ ها به سایر قسمت های گیاه.
2- نگهداری اندام های هوایی گیاه
3- ساختن مواد غذایی در ساقه های جوان حاوی کلروفیل
4- ذخیره مواد غذایی