تحقیق زیست شناسی رشدی تکامل در حجم 30 صفحه و در قالب word و قابل ویرایش و با قسمتی از متن زیر:

در سرتاسر دو سه دهه ی اخیر زیست شناسی رشد ثابت کرده است که تمام موجودات زنده ی پر سلولی سلسله ی جانوران تشکیل شده اند از بسیاری از بلوکهای ساختمانی مولکولی مشابه و بسیاری از مسیر های ژنتیکی مقطع مشابه . با این وجود ما هنوز نمی فهمیم که چطور در موجودات مختلف این مولکولها و روشهای ژنتیکی را به کار بسته اند تا مشکلهایی که ما امروز می شناسیم بوجود بیاورند .

زیست شناسی رشدی تکامل از  عهده ی این مشکل بر آمده است بوسیله ی مقایسه کردن تکامل یک موجود زنده به دیگری و مقایسه ژنهای درگیر و عملکرد ژنها تا بفهمد که چگونه یک موجود زنده به دیگری تغییر می کند در این مطالعه ما بازنگری می کنیم یک سری هفت تایی از مفاهیم .

مشخص شده بوسیله ی   Lewis Wolpert   (نقشه های سرنوشت ، تقسیمات نا متقارن ، منصوب شدن ، کارآیی ، اطلاعات موقعیتی ، معین سازی و جلوگیری جانبی ) که صفات بسیاری از سیستمهای رشدی و تکمیل کردن آنها را به وسیله ی سه مفهوم اضافی (Genomic  های رشدی ، Redunclancy  ژنتیکی و شبکه های ژنتیکی ) شرح می دهد.

ما مثالهایی از مطالعات رشدی ، مقایسه ای بحث خواهیم کرد که این مفاهیم مشاهدات را به سمت ظهور یک بدعت رشدی  هدایت کرده است . در نهایت ما یک چهار چوب تکاملی را می شناسیم از قبیل محدودیتها ، همیاری ها ، نسخه برداری ها و همسانی های تکملی و تکامل همگرا و تشابه ساختمانی را برای اینکه به مقدار کافی خواص تکاملی سیستمهای رشدی را شرح دهیم .

مقدمه : ( Interoduction )

در سال 1994 لویس و ولپرت به این نکته اشاره کرد که بسیاری از سیستمهای رشدی می توانند بوسیله ی تعداد نسبتاً کمی از مفاهیم شرح داده شوند : نقشه های سرنوشت ، تقسیم نامتقارن ، منصوب شدن ، صلاحیت ، اطلاعات موقعیتی ، تعیین و بازداری جانبی این مفاهیم هفت گانه در حالیکه نسبتاً وسیع هستند جامع نمی باشند . مخصوصاً مفاهیم مولکولی اضافه شامل Genomics , Redundancy  و شبکه های ژنتیکی در سالهای اخیر اهمیت زیادی پیدا کرده اند . تمام این مفاهیم مفید هستند برای راهنمائی مشاهدات و آزمایشات به سمت سیستمهای مدل پاسخگویی سنتی در طول تولد و بلوغ زیست شناسی رشدی .

به عنوان نتیجه در طول دو سه دهه ی گذشته آزمایشات راهنمائی شده به وسیله ی این مفاهیم اثبات کرده اند که همه ی موجودات تشکیل شده اند از تعداد زیادی بلوکهای ساختمانی ملکولی مشابه و بسیاری مسیرهای ژنیتیکی منظم مشابه (Gerhart,Kirschner,1997,Hall1978,Raff1996,Wilkins2002  ) با وجود این ما هنوز نفهمیدیم که چطور موجودات گوناگونی این مولکولها و مسیر را برای نشان دادن تمام شکلها که ما اکنون می شناسیم استفاده می کنند و این وظیفه عرصه های زیست شناسی رشدی تکامل است . زیست شناسی رشدی تکامل در اصل زیست شناسی مقایسه ای است مقایسه تکامل یک موجود زنده به دیگری و مقایسه ژنهای درگیر ژنهای عمل کننده برای مقایسه کردن بر مشاهده ، بحث و آزمایش تکیه می کند . حالا که اطلاعات عملکردی در مورد بسیاری از ژنها در موجودات نمونه در دسترس است ، توالی ژنومی کامل برای مطالعه در دسترس است. وسایل مولکولی  توسعه پیدا کرده اند طوریکه می توانند از مرزهای مختلف عبور کنند ، آیا مفاهیم کافی برای شرح تغییرات در زمینه رشد ، در میان موجودات زنده مربوط به هم وجود دارد؟

در این خلاصه ما برای هر کدام از مفاهیم ده گانه یک تعریف مختصر از مفهوم را ارائه خواهیم داد، یک مثال از سیستم رشدی مقایسه ای را شرح می دهیم ، جائیکه مفهوم مورد نظر مشاهدات را به سمت ظهور یک بدعت رشدی هدایت کرده است ، اطلاعات آزمایشگاهی را شرح می دهیم و سیستم و نتایج را در یک زمینه  تکاملی قرار می دهیم . در نتیجه اگر گرایشاتی بنیان گذاشته شده باشند ما متوجه خواهیم شد و بحث خواهیم کرد که آیا این مفاهیم برای توضیح تکامل مکانیسمها ی رشدی کافی خواهد بود چنانچه برای فهمیدن خود مفهوم رشد کافی بوده اند . باید به این نکته توجه کرد که این مفاهیم توضیح داده شد جدا از هم نیستند و از لحاظ مفهوم اشتراکاتی با هم دارند . همچنین ، بسیاری از عناصر رشدی در مراحل متعدد درگیر هستند بعضی از آنها ممکن است بوسیله یک یا چند تا از این مفاهیم تعریف شوند . ما بر مشاهدات اخیر و گستره پژو هشها ی پویا متمرکز می شویم

نقشه ی سرنوشت :

مور فولوژی نماتودها و تخمدان ( Fate Maps  ) 

یک نقشه ی سرنوشت منشا یک سلول را از سلولهای بنیادی یا یک زمینه ی سیتوپلاسمی به سلول تخم ترسیم می کند . دودمان سلولCelegans کامل شده در اصل یک مثال افراطی از یک نقشه ی سرنوشت است (Sulston 1983 , Kimble,Hirsh1979, Sulslon, Horvitz1977 ) ، نقشه های سر نوشت گونه های مختلف نماتودها می توانند تغییراتی که در طول تکامل رخ داده است را بشناسانند . نمادها گستره ی متنوعی از مورفولوژی که در طول تکامل رخ داده است را بشناسانند . نماتو دها گستره ی متنوعی از مورفولوژی گنادها را ارائه می دهند ( Malakhov 1994 ) اولاً در هر گونه گنادها دو شکلی جنسی را نشان می دهند . ثانیاً : در میان گونه ها اشکال گنادها به طرق مختلف از قبیل بازوها ی گناد تغییر می کنند. دودمان سلولهای Celegand  توضیعی برای دو شکلی جنسی گناد ها و اساسی برای یک مدل از پیرایش گناد ها تامین می کند .

Celegans دو جنس دارد . هرمافرودیتها یعنی ماده ها کلیه می توانند مقداری اسپرم تولید کنند و نر ها . گناد ها هرمافرودیت Didelphic  است . شامل دو لوله ی برگشت متقارن دورانی بدنی که رشته ی تخمها و جنینهای تخمگذاری شده را احاطه می کند بازوهای گناد هرمافرودیت به درون رحم خالی می شوند جائیکه جنین انباشته شده است در حالیکه منتظر خارج شدن از درون مادگی انتهای نزدیک مرتبط با مادگی قرار دارند مادگی ها نزدیک هستند ] شکل A1  به دیاگرام بزرگ توجه کنید[  .

گناد نر مونودلفیک است شامل یک بازوی گنادی منفرد که به اندام جنسی نر می پیوندند (در کلواک) که برای جفت گیری تخصصی شده اند ؛ گناد بدنی و خط جنینی نزدیک به انتها با ارتباط به کلواک قرار گرفته اند (شکل 1B  به دیاگرام بزرگ توجه کنید).

گناد های هرمافرودیت سلولی نر و از یک پریمودیوم گنادی متقارن ظاهراً یکسان تکامل یافته اند ؛ هر چند یک دو جنس گنادها از یک سری چهار سلولی مشابه شروع شده اند ؛ Z4 , Z7   پیش ماده های بازوهای گناد های بدنی و Z3,Z2   سلولهای جنینی ابتدایی (شکل قسمت A,B  ) .

در هرمافرودیتها تقارن پایه گذاری شده در پریموریوم گنادی در سرتاسر رشد اندام حفظ شده است ( شکل 1A ) . در هرمافرودیتها و نر ها تقسیم اولیه Z1,Z4   متقارن است . در هرمافرودیتها اعقاب (فرزندان ) Z1,Z4   ادامه می دهند به تقسیم شدن به روش مقارن یک سلول راسی Ddistal   منفرد (DTC) از تقیسمات اولیه هر پیش ماده ی بدنی متولد می شود و در هرمافرودیتها DTC ها دو عمل دارند ؛ آنها بعنوان سلولهای راهنما برای بازوهای گنادی اضافی عمل می کنند و خط جنینی برای حفظ یک جمعیت سلول جنینی میتوزی [1989 Kimble, Austin, 1987 Kimbel , Austin]  .

پس از ریشه کنی DTC ها بازوها دراز نمی شوند و تمام سلوهای جنینی از میتوز خارج شده به میوز وارد می شوند و به صورت گامتها متفاوت می شوند . در مقایسه در نر ها نسل Z1, Z4   بازآیی می شوند و تقارن در گنادهای رشد یافته شکسته می شود (شکل B1 ).

سرانجام دو تا از DTCها در قسمت عقبی و سلولهای بدنی باقیمانده در قسمت جلویی قرار دارد می گیرند جایکه یک سازمان دهنده اختصاصی بازوی جنینی انجام وظیفه می کند [1979 Hirsh , Kimble]  .