در شبیه سازی مولکولی مولکول ها و اتم ها در داخل جعبه شبیه سازی حرکت می کنند و بر اساس برهمکنش های درون و بین مولکولی که با یکدیگر دارند، مولکول ها و اتم های مورد بررسی در راستای رسیدن به کمترین سطح انرژی و تعادل سیستم حرکت می کنند. جابجایی مولکول ها بر اساس الگوریتم های مختلفی انجام می شود که به روش شبیه سازی مولکولی انتخابی بستگی دارد. در این فیلم آموزشی روش دینامیک مولکولی و مونت کارلو بصورت ساده و مختصر بررسی می شود.

اولین مرجع تخصصی و جامع شبیه سازی مولکولی (نانوفناوری محاسباتی) در ایران